Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms