Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clvs1Q9D4C9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clvs1Q9D4C9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms