Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4933428M09RikQ9D3X3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms