Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx29Q9D3S3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx29Q9D3S3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms