Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nol3Q9D1X0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nol3Q9D1X0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms