Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms