Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl52Q9D0Y8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms