Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms