Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Elp3Q9CZX0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms