Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms