Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ15

Gins1, DNA replication complex GINS protein PSF1, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins1Q9CZ15 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gins1Q9CZ15 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gins1Q9CZ15 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms