Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrps28Q9CY16 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms