Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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