Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms