Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d3Q9CSV6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms