Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msmo1Q9CRA4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msmo1Q9CRA4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msmo1Q9CRA4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msmo1Q9CRA4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msmo1Q9CRA4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms