Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1lc3bQ9CQV6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1lc3bQ9CQV6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms