Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms