Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI6

Cotl1, Coactosin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cotl1Q9CQI6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cotl1Q9CQI6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms