Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms