Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chchd1Q9CQA6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Chchd1Q9CQA6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Chchd1Q9CQA6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Chchd1Q9CQA6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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