Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp2Q9CQ73 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms