Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms