Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ28

Dph6, Diphthine--ammonia ligase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph6Q9CQ28 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dph6Q9CQ28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph6Q9CQ28 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms