Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim26Q99PN3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms