Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl3Q99N95 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms