Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6cQ99N08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6cQ99N08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms