Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PccbQ99MN9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms