Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rwdd2bQ99M03 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rwdd2bQ99M03 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms