Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gins4Q99LZ3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gins4Q99LZ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms