Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q99LU8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q99LU8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q99LU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q99LU8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q99LU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q99LU8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q99LU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q99LU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q99LU8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q99LU8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q99LU8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q99LU8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q99LU8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99LU8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99LU8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99LU8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99LU8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99LU8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99LU8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q99LU8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q99LU8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q99LU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99LU8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99LU8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99LU8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99LU8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99LU8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99LU8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99LU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q99LU8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms