Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lactb2Q99KR3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lactb2Q99KR3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms