Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms