Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GatbQ99JT1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms