Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Clstn3Q99JH7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn3Q99JH7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms