Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Derl1Q99J56 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl1Q99J56 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms