Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CsprsQ99388 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CsprsQ99388 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms