Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Neurl1Q923S6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Neurl1Q923S6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms