Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf7Q922B6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms