Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med28Q920D3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms