Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Afg3l1Q920A7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Afg3l1Q920A7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Afg3l1Q920A7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Afg3l1Q920A7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Afg3l1Q920A7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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