Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin3bQ91ZU9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin3bQ91ZU9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin3bQ91ZU9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms