Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Pde6cQ91ZQ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Pde6cQ91ZQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde6cQ91ZQ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Pde6cQ91ZQ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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Pde6cQ91ZQ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Pde6cQ91ZQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Pde6cQ91ZQ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Pde6cQ91ZQ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Pde6cQ91ZQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Pde6cQ91ZQ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde6cQ91ZQ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms