Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdha12Q91Y18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdha12Q91Y18 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdha12Q91Y18 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms