Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SelenomQ8VHC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelenomQ8VHC3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenomQ8VHC3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms