Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul7Q8VE73 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul7Q8VE73 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cul7Q8VE73 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms