Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc9Q8VC31 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms