Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ApobrQ8VBT6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ApobrQ8VBT6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms