Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlrp3Q8R4B8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp3Q8R4B8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms