Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc58Q8R3Q6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms